Ze środków Programu Pomoc Techniczna mogły być finansowane następujące zadania realizowane przez instytucje systemu wdrażania Narodowej Strategii Spójności (beneficjentów programu):
- wynagrodzenia wraz ze składkami na ubezpieczenia społeczna i fundusze pozaubezpieczeniowe płacone przez pracodawcę oraz regulaminowe nagrody pracowników odpowiedzialnych za zarządzanie, programowanie, wdrażanie, monitorowanie, ocenę, audyt, certyfikację i kontrolę oraz promocję i informację Funduszy Europejskich,
- podnoszenie kwalifikacji pracowników odpowiedzialnych za programowanie, zarządzanie, wdrażanie, monitorowanie, ocenę, audyt, certyfikację i kontrolę oraz promocje i informację,
- finansowanie wydatków organizacyjnych i administracyjnych związanych z realizacją celów NSRO,
- finansowanie wydatków związanych z zamknięciem pomocy,
- zakup sprzętu, oprogramowania i wyposażenia służącego realizacji celów NSRO,
- finansowanie wydatków na przygotowanie przyszłych interwencji strukturalnych,
- przygotowanie analiz, badań, ocen, sprawozdań oraz finansowanie pomocy ekspertów zewnętrznych w celu opracowania optymalnego systemu wdrażania i zarządzania NSRO,
- utrzymanie i rozwój systemu informatycznego monitoringu i kontroli,
- finansowanie działań z zakresu promocji i informacji oraz działań szkoleniowych wspomagających system zarządzania i wdrażania NSRO,
- finansowanie wydatków związanych z funkcjonowaniem komitetów monitorujących i sterujących, w szczególności z ich powołaniem i obsługą, organizacją posiedzeń oraz uczestnictwem członków komitetów w posiedzeniach,
- finansowanie wydatków związanych z kontrolą,
- finansowanie wydatków związanych z oceną projektów,
- finansowanie wsparcia instytucji odpowiedzialnych za wdrażanie programów operacyjnych w związku z przygotowaniem projektów kluczowych (project pipeline).